De oorspronkelijke kerk, waarschijnlijk romaans, werd aan het einde van de 16e eeuw tijdens de godsdienstoorlogen gedeeltelijk verwoest.
De overblijfselen, die aan de noordzijde nog goed zichtbaar zijn, doen vermoeden dat de kerk ongeveer dezelfde afmetingen had als het huidige gebouw. Rondom lag een groot kerkhof. In de 17e eeuw telde Désaignes naar schatting bijna 4.000 inwoners.
De nieuwe kerk werd in verschillende fasen herbouwd. Eerst werd het koorgedeelte voltooid, rond 1636. Twintig jaar later, in 1656, werd het gebouw uitgebreid tot het dubbele van zijn oorspronkelijke lengte.
Deze datum (1656) is in de kerk terug te vinden op een gebeeldhouwde steen in het gewelf van de rechter zijbeuk.
De klokkentoren werd gebouwd in 1657. Deze datum staat in een steen van de toren gegraveerd en markeert grotendeels het einde van de heropbouw. In 1668 werd de toren nog met ongeveer 3 meter verhoogd.
In de 19e eeuw vonden opnieuw werkzaamheden plaats, met name aan de voorgevel.
De kerk is bovendien recent gerestaureerd.